全譜共二十六卷，《九宮譜》與《十三調(diào)譜》合為一譜，十三調(diào)之曲附于九宮之后，各為一卷，其中卷十一、卷二十分別為新移補(bǔ)的道宮調(diào)與商黃調(diào)，卷二十五為附錄不知宮調(diào)引子、過曲，最后一卷為《各宮尾聲格調(diào)》。卷首保留沈譜原有的蔣孝《南詞舊譜序》和李鴻《南詞全譜序》，又新增《復(fù)位南詞全譜凡例》《復(fù)位南詞全譜凡例續(xù)紀(jì)》《古今入譜詞曲傳劇總目》，《凡例》表明修譜的十項原則，即遵舊式，稟先程，重原詞，參增注，嚴(yán)律韻，慎更刪，采新聲，稽作手，從詮次，俟補(bǔ)遺。全譜選收南曲曲調(diào)一千多支，在沈譜的基礎(chǔ)上，增收明末曲家新創(chuàng)曲調(diào)274首，新?lián)Q范曲33首，并據(jù)馮夢龍《墨憨齋詞譜》補(bǔ)入35首。凡新增或新?lián)Q范曲者，皆在卷首曲目下注明“新入”“新查補(bǔ)”“新?lián)Q”“馮補(bǔ)”等字。在新增收的曲調(diào)中，多為集曲。另對沈譜的詮注作了增注和修正，在所增的注文上標(biāo)以一小尖圈為別。此譜因有沈譜為基礎(chǔ)，且能結(jié)合當(dāng)時的曲壇實(shí)際，故為當(dāng)時的作曲填詞提供了較好的規(guī)范，并對后世的南曲譜產(chǎn)生了一定的影響。